Anticonceptivos y problemas estomacales

Saludos, mi caso es el siguiente, durante este mes tome mi píldora correctamente todos los días sin embargo estuve en tratamientos con antibióticos (use métodos alternos para cuidarme como lo indican) pero resulta que justo a dos días para finalizar mi ciclo tuve un problema digestivo presentando diarreas. El jueves tome mi pastilla a la hora de siempre y tres horas después empecé con la diarrea (no tome otra como sugiere el prospecto) porque los dolores eran muy intensos e igual estaba con vómitos, al día siguiente (el viernes) me alivie un poco y a la hora de costumbre tome la ultima píldora de mi blister.
Ahora empece mi semana de descanso, mi duda es: al comenzar un nuevo blister puedo corregir "las fallas" que tuve en el ciclo anterior?? ¿en cuantos días estaré completamente protegida?
Espero haberme explicado correctamente. Muchas Gracias.