Duración proceso incapacidad

Hola.

Llevo seis meses de baja, y me ha dicho el médico que va a solicitar una incapacidad absoluta ya que mis secuelas son irreversibles. Lo que me gustaría saber es cómo va todo el proceso, el tiempo aproximado que puede tardar en estar todo resuelto. Yo soy trabajar autónomo, supongo que durante todo el proceso hasta que no me la concedan las cuotas y todo lo tengo que seguir pagan igual ¿no?

Gracias.