Te comento para poder empezar a leer algo te recomiendo un par de links:
http://www.microsoft.com/technet/prodtechnol/sql/2005/newsqlagent.mspxUna página de Microsoft donde comentan las diferencias entre SQL 2000 y 2005, donde podrás ver las diferencias entre los dos motores.
http://www.sql-server-performance.com/articles/dba/creating_backup_jobs_p1.aspxUno de los mejores tutoriales que he visto acerca de Jobs de SQL SERVER. Este sitio es un sitio especializado en SQL SERVER y tiene muy buenas notas.
Te cuento también que para realizar la migración de SQL SERVER 2000 a 2005 existe un script que hace una gran parte del trabajo. Si lo llegaras a necesitar pedírmelo que de alguna manera arreglamos para poder pasártelo.
Espero te sirva, cualquier otra duda, no dudes en volver a preguntarme