Que es lo más recomendable WEB o WinForm

Me alegro que me hagas esta pregunta, pues he llevado a cabo cambios de programas de escritorio a programa Web en grandes empresas.
Mi contestación no podría ser más clara: un desarrollo Web.
Las ventajas de los desarrollos Web sobre las aplicación de escritorio son innumerables:
- No hace falta instalación.
- Es muy sencillo llevar a cabo los procesos de mantenimiento y mejora.
- Al ordenador sólo le hace falta tener conexión a una red (en tu caso la intranet): da igual el sistema operativo y el navegador.
- La carga de trabajo recae en el servidor, no en el equipo del usuario. De ese modo, ordenadores "viejos" pueden ejecutar el programa Web sin problemas.
En cuanto a lo que te preocupa, como imaginarás la aplicación Web debe estar "bien hecha". Sobre todo debes cuidar la base de datos y el acceso a base de datos.
Por ejemplo Oracle, SqlServer o incluso MySQL (que a pesar de es libre es muy potente y estable). Obviamente no puedes hacerlo con Access o SqlServer Express (si te contara las cosas que he llegado a ver...).
Espero haberte ayudado :D

Ok muchas gracias por tu respuesta, solo una cosa más, es que quiero estar claro y que pasa con lo retardo en las respuesta a una consulta, por ejemplo si ya tienes la página cargada y con todos sus controles y por ejemplo solicitas un dato de un combo, tengo entendido que una acción simple como esta redirecciona de nuevo la página entera con todo su contenido al servidor, carga de nuevo la información y la regresa a la pantalla del usuario, mi punto es esto no hace más lento las operaciones por que por cada cosa que cambie en mi pantalla va al servidor y regresa de nuevo a mi, lo que se conoce con Post - Back, yo no estoy haciendo la aplicación en mención, la esta haciendo un tercero, pero el mantenimiento de esta me quedara a mi y es por ello que quiero estar claro por que los jefes ya me preguntaron si era buena idea hacer la aplicación contable en WEB.
Por favor me puedes dar esta ultima aclaración. Gracias.