Te pase un link, el primero de todos donde tenes un ejemplo completo de todas las posiciones mas "convencionales" de las etiquetas:
http://css-tricks.com/snippets/html/html5-page-structure/
Te paso otros mas para que tengas referencias:
http://www.turtleblog.co.uk/2011/04/whats-new-to-html5/
http://www.marcofbb.com.ar/estructura-completa-html5/
A partir de la estructura, despues, desde CSS estilizas todo como siempre lo hiciste. Digamos, si comprendes que las nuevas etiquetas son, al fin, etiquetas y ya, podes darle estilos en linea, por class o ID, o hasta por etiqueta misma.
Basicamente, son como divs y spans, pero cada una tiene un sentido semantico. Podes manupularlas como quieras desde los estilos. Solo que ahora tenes que comprender su uso para aplicarlas cuando corresponda... y cuando, usas los DIVS!
SI no es esta la respuesta, no comprendo tu pregunta!
Creo que es cuestion de que tomes algun ejemplo de los que te pase, y comiences a estilizarlos. Te repito: son como divs con sentido. Por ende, manupulalos como se te de la gana en CSS, pero siempre teniendo en cuenta su "uso correcto" (relativo, como siempre) segun su semantica.
Si aun no he podido ayudarte, repregunta de nuevo y dame mas detalles de la duda porque quizas no nos estamos entendiendo!