Disco duro externo

Siento darte malas noticias, pero tu disco duro jamás podrá ejecutar un programa por si sólo. La explicación es que para poder ejecutar un programa (imagino que te refieres a un programa para MS Windows, pero eso en el fondo da igual) se necesita un procesador y una memoria que tu disco externo no tiene.
Si me explicas un poco más que es exactamente lo que quieres hacer con ese disco, quizás podamos encontrar una solución alternativa.

Si es un programa DOS, yo se que no se puede que necesito de un bios para cargar el sistema operativo ademas de memoria ram rom etc., pero como se podría decir que en la vida nada es imposible; bueno concretamente lo que quiero es utilizar o convertir mi disco duro externo en una memoria flash gigante, se podrá o en definitiva nunca se podrá hacer
Gracias por responder

Sigo sin entender que quieres hacer. Tu disco duro ya es "una memoria flash gigante", es decir, se comporta igual que una memoria flash, solo cambia la tecnología de almacenado. Tampoco se pueden ejecutar programas dentro de un lápiz USB si este no está conectado a un ordenador.
Cualquier dispositivo que almacene memoria, externo o interno, ya sea un disco duro, un floppy, un disco DVD, memoria RAM o memoria flash, jamás va a poder ejecutar ningún tipo de programa, y esto te ha de quedar claro.
Otro tema son los reproductores MP3/MP4 (como el iPod) o los discos duros multimedia o un reproductor DVD de sobremesa. Estos dispositivos añaden un hardware (y en ocasiones un software) que les permiten realizar funciones como reproducir música o video. Pero pueden porque está presente ese hardware y/o software dedicado. Un disco duro externo común, como debe ser tu caso, no es más que un disco duro interno de tu PC pero con un adaptador de corriente y un conversor SATA/PATA a USB. Carece de esos chips que le permiten ser autónomo.
Te vuelvo a repetir que si me explicas exactamente que quieres hacer, quizás hallemos una solución.

Si tienes razón, es como una memoria flash, como podría hacer que ese disco externo se vuelva host pero bidireccional para explorarlo desde un dispositivo que no tiene un sistema operativo, solo tiene un explorador y la entrada que tiene es mini usb; pero para poder explorarlo tengo que activar el host en ambos

Creo que lo que quieres es poder acceder al disco duro desde un reproductor MP3 o similar a través de una conexión USB ¿Me equivoco? El problema es que seguramente ese explorador no ha sido diseñado para unidades externas, y por tanto no tiene capacidad para leer por el puerto USB. No es una cuestión de tu disco duro, ni tienes que activar nada en él, el tema es el dispositivo que quieres usar como lector.
Es como las cámaras de fotos digitales. Tienen un hardware que permite leer y manipular su memoria interna, pero ninguna (que yo sepa) puede gestionar una memoria conectada por USB. No es que técnicamente no sea posible, sencillamente no añaden esa función para no aumentar los costes. Como todos estos dispositivos, MP3, cámaras de fotos/video, etc, no tienen un Sistema Operativo que podamos programar, modificar sus funciones se hace en la mayoría de los casos imposible.
No se si esto soluciona tus dudas. Cualquier duda me la preguntas.