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Si vas a conectar los dos vas a tener que poner a uno de ellos como master y el otro como slave, la mayoría de HDD tienes unos pins detrás que pueden especificar eso, y algunos vienen con instrucciones, normalmente tienes que conectar el jumper donde te indique MS que es master y el otro en SL que es slave o esclavo(por ejemplo el de 120 ponlo como MS y el de 60 como SL).. olvidate del CS. Estos jumpers tienen para conectar dos pins comúnmente.. luego que hayas conectados los jumpers en sus respectivos HDD conecta un extremo del cable IDE a la motherboard (el indicado claro) y el otro extremo al Disco Master, y el conector que esta en la mitad del cable ponlo en el disco slave SL, luego fíjate que el bios estén configurados correctamente como master y esclavo..
Algunos discos duros usan dos jumpers osea cuatro pins pata determinar su rango (MS o SL)..
Cualquier problema házmelo saber..