Error en el inicio de windows 2003

Hola, tengo un inicio dual con XP y Win2003 (instalados en particiones distintas). Funcionaba perfectamente, pero ahora cuando selecciono arrancar con el win2003 se reinicia solo.
Alguna vez que me ha pasado esto lo he solucionado con el cd de windows 2003 y reparando el sistema.
Me gustaría saber si se puede hacer sin el CD. Ya he mirado el archivo boot.ini, pero está correcto.
Un saludo.