Transferencia lenta Usb Disco duro externo

Eso debe ser que el sistema de archivos se ha fastidiado. Lo que deberías hacer es salvar todos los datos que tienes y destruir todas y cada una de las particiones. Después volver a crearlas y asignar a cada partición el espacio que quieras.

Pero si puedo pasar archivos solo cuando son grandes o pesados, la otra partición como te digo la uso para cargar juegos en mi wii y ayer hice una prueba cargando otro juego y lo paso bien, sin problemas

Hay muchos factores que hacen que la tasa de transferencia disminuya. En el caso de los portátiles por ejemplo, a veces la configuración de ahorro de energía hace que baje esta tasa. Si la carcasa de tu disco duro es muy exigente en cuanto a consumo de energía, el portátil puede hacer que el usb funcione como un usb 1.1 para portegerse del excesivo consumo de energía.
Otro factor es el estado del disco duro externo: Por ejemplo el hecho de que lo tengas particionado podría influir, pero sobre todo puede influir que esté muy fragmentado y con muchos sectores erróneos.
Yo intentaría aplicar alguna medida de mantenimiento del disco como puede ser hacer un ChkDsk y después un Defrag.
Primero lanza un ChkDsk. Desde una ventana de comandos teclea la siguiente instrucción:
CHKDSK X: /R /P
Reemplazando X: por la unidad asignada al disco duro que quieres reparar. Esto verificará y reparará posibles sectores defectuosos de tus discos.
Después realiza una defragmentación del disco.
Con esto seguro que mejorará la tasa de transferencia. Si no es así vuelve a contactar conmigo y veremos otras posibilidades.

Todo el procedimiento que me describes ya lo hice y salio bien, el case tiene alimentación de energía externa se supone que tiene buffer de 8mb y de repente paso esto porque si traspasaba bien y rapido los archivos, ¿qué más puedo hacer? Ya actualice los controladores de usb que estaban ya algo pasados pero de todos modos sigue igual

Bien, tenemos que ir descartando cosas.
¿Has probado el dispositivo externo en otro ordenador? ¿Has probado en tu máquina otro dispositivo externo similar al que te está dando problemas?
Intenta hacer estas pruebas, pues no podremos seguir adelante y si no delimitamos el problema.

Fíjate que escuche que quitara por un rato mi antovirus y si me funciono, ya pase la mayoría de las pelis, pero quise pasar una de 4.3gb y siguió el problema, voy a intentar con un iso de ese tamaño para checar, te aviso, pero de igual forma ayudame a revisar sale

Este tipo de problemas se presenta por diversas causas las cuales debes ir descartando:
1) El cable USB con el que conectas tu disco este dañado, mal conectado o tenga algún falso contacto
2) El puerto USB al que lo estas conectando este fallando, estos se deterioran de tanto conectar y desconectar los dispositivos
3) Si cuentas con un antivirus como el kaspersky estos revisan la información mientras se copia alentando el proceso
4) Puede ser que tu disco duro tenga algún daño físico o lógico, por eso al copiar archivos grandes presente ese problema, checalo con alguna herramienta para verificar su estado, pero de preferencia conéctalo directamente a tu placa principal ya que por USB no lo verifica igual

Tengo como 3 cables usb, y ya los probé y nada, tengo tres puerto usb y pasa lo mismo, tengo el esed nod32 pero tampoco creo sea el problema, ¿el disco duro lo acabo de analizar y derla un scandisk y defragmentación y no me resulto ningún problema que puedo hacer?

Realizaste el análisis del disco conectándolo directamente a tu placa principal como te mencione anteriormente, si es así prueba en otra maquina para saber si el problema es de tu computadora o de tu disco duro...

Ya revise el problema llevo un 70% de avance, tengo que desactivar el antivirus ya que es el responsable de que trabaje la transferencia tan lenta, lo hice y así paso, se arreglo, pero estoy queriendo pasar unas pelis de 4.3 gb y no pude

Pues es lo que yo te comente del antivirus y es que el archivo que quieres pasar es muy grande y el trasnferirlo por usb es más lento más si no cuentas con puertos usb 2.0, yo te recomendaría que lo conectaras directamente a tu placa principal para que sea más rapido...