Archivos deaparecidos

Hola, veras, me ha pasado una cosa increíble:
Se me han borrado un montón de carpetas de "archivos de programas".
Delante de mis morros fueron desapareciendo una a una las carpetas y apague el ordena de golpe.
Resulta que la mitad de los programas no están y la otra mitad no funcionan o funcionan mal.
A que puede ser debido, ¿hay un virus capaz de hacer esto?
Ahora voy a hacer un format c:
Y a instalarlo todo, porque pa lo que me ha dejado...
Gracias, y tranquilo que finalizo la pregunta...