Contraseña para pentdrive/llave USB

Sí es posible hacer que la información que tienes en un pendrive no sea accesible a todo el mundo: el método más fiable es cifrar la información que guardas en él. Con el cifrado del dispositivo te aseguras que, matemáticamente, nadie podrá acceder a la información contenida en él en caso de pérdida/robo.
Con este programa (http://www.truecrypt.org/) puedes cifrar todo el dispositivo o sólo una parte. Con la primera opción, todos los datos están protegidos en caso de pérdida/robo; con la segunda, creas un "contenedor" en el que metes todo lo que quieres proteger. La segunda opción es válida si tienes información que no te interesa proteger, como manuales, etc. y quieres acceder rápidamente a ella. La primera opción es un poquito más tediosa, aunque te proporciona una protección total. El programa es completamente gratuito y no es complicado de usar; te aseguro que las ventajas compensan el tener que leer su manual de uso.
Por si no te convence esta opción, existen programas para proteger mediante contraseña un dispositivo (http://www.softonic.com/s/protege-usb), aunque no te la recomiendo porque al final se puede acceder a la información contenida en el dispositivo, por ejemplo utilizando un sistema operativo como Linux.
Espero que todo el rollo te haya servido para algo!