Permisos

Hola tengo echo un script en cgi para activar los servicios, en modo consola se ejecuta perfectamente porque se ejecuta como root, si me cambio de usuario y entro como wwwrun que es el usuario del navegador me da fallo y cuando lo hago por el navegador el script se ejecuta pero el servicio no se inicia.
He mirado que en el navegador el usuario es wwwrun, he mirado todo sobre permisos y también el comando sudo pero nada.
Por favor contesta urgente
Un saludo