Fat 12

Me imagino que probablemente tengas problemas con alguna cámara fotográfica vieja que no te reconozca el fat32, dejame explicarte un poco, para formatear en fat12 es decir 2^12, son 4096 clusters, lo cual es aproximadamente un valor de 32 mb de disco duro, en ese espacio no te entraría ningún sistema operativo que no sea dos, en segundo lugar, la partición no es la que se encarga de detectar tu puerto USB, es el sistema operativo en si el que lo detecta y lo configura, si tu problema es el de una cámara no reconocida te recomiendo que pruebes primero con fat16, si no te da resultado intenta formatear el disco con el discwizard de tu disco duro (que es gratuito) y prueba formatenado con 12 bits por clusters poniendo en tipo de partición "no definida"