Filtros

¿Se puede? La verdad es que no sé y no creo.
Pero lo que si puedes hacer es usar una función personal sencilla que coloque un código a cada color (en una celda al lado) para que puedas filtrar a través de dicho número. La función puede ser algo así:
Public Function Color(celda As Range, x As Integer)
If x = 1 Then
Color = celda.Font.ColorIndex
Else
If x = 2 Then
Color = celda.Interior.ColorIndex
End If
End If
End Function
Los argumentos para esta función serían:
=COLOR(celda,tipo)
Celda = La dirección de la celda a evaluar
tipo = 1 para el color de la fuente y 2 para el color de la celda.