Herencia y usufructo vitalicio. Tras fallecer nuestro padre (se casó con otra persona y no se quiere ir)

Nuestro padre se casó después de fallecer nuestra madre y terminamos de hacerle una casa que por herencia nos correspondía a los hijos, se la dejamos a nuestro padre en usufructo y vivió con ella hasta su fallecimiento. Ella pagó una serie de cosas como carpintería, etc.. Que en un escrito se dejo la cantidad aportada y que tras el fallecimiento de padre tendría hasta 2 años para irse, ahora han pasado 5 años y como todavía no la hemos pagado esa cantidad dice que no se va a ir, por fin vamos a proceder a tramitar la herencia, mi padre dejó testamento en el que ella tiene una parte de un terreno, ¿cómo tenemos que proceder y en cuanto a esa señora como tenemos que actuar?