Devolución de IVA en una S.A

Somos un pequeño negocio con forma de sociedad anónima, tal y como nos comentó el gestor no hacia falta el nif en el caso de pequeñas ventas a nuestros clientes online, ahora queremos solicitar la devolución de IVA y nos han comentado que siempre suele haber inspección

¿Qué considera hacienda como correcto para que no acabe en sanción? ¿Las facturas sin nif pasaría algo?