Interina por baja maternal embarazada

Estoy trabajando con contrato interinidad para sustituir trabajadora con baja maternal. Ahora estoy yo embarazada y quisiera saber qué pasa en estos casos. Porque cuando ella se incorpore yo igual estoy de baja por problemas en el embarazo .Y también quisiera saber cómo afecta a la empresa, pues ahora tiene bonificaciones por mi contrato y no paga por mi, entonces si me doy de baja por problemas en el embarazo, lo que es una IT normal, no se si seguiría sin cotizar por mi o tendría que hacerlo