IVA en régimen especial de agencias de viaje

Tengo una cuestión en relación al régimen especial de agencias de viaje.

Me he leído la normativa básica del régimen especial de agencias de viajes y conozco la teoría sobre que la base del iva es el margen bruto y sobre que a este se aplica el tipo de iva 21% etc

¿Pero cómo se calcula el margen bruto si tanto las facturas de gasto como de ingreso son en régimen especial? ¿Cómo se pone en el modelo 303?

Agradecería que alguien me diera respuesta a este tema.