Archivo ejecutable que copie carpetas especificas dentro de una carpeta a varias carpetas

Tengo una carpeta de nombre variable que contiene varias subcarpetas que deben de ser copiadas a un servidor para compartir los archivos específicos que están dentro de las mismas con grupos de personas con diferentes niveles de acceso(de ahí que se copia al servidor).

El problema se da como sigue:

Como debo de realizar esta acción por cada carpeta nueva con datos que se crea me lleva una enorme cantidad de tiempo realizarlo por lo cual estoy queriendo automatizar la copia, no puedo realizarlo con un programa que haga backup ya que los nombres de las carpetas son nuevos siempre, por lo cual estaría necesitando algún tipo de ejecutable que tome el nobre de la carpeta que lo aloja, cree una con el mismo nombre en el servidor y copie ciertas carpetas (estas con nobre fijo) a la nueva carpeta en el servidor.