Si encargaste el cambio a un servicio técnico, los que deberían solventar el problema son ellos, pero bueno. Lo que comentas es raro, sería mas lógico que te pasara lo contrario, que al apagar el ordenador arrancara desde el disco incorrecto, con lo que el problema podría estar relacionado con la pila que lleva la placa y que perdiera el orden de arranque. Puedes mirar 2 cosas.. Primero asegúrate de que no ha quedado un resto de configuración del sistema antiguo en el orden de arranque de sistemas operativos. Abre las propiedades del sistema: pulsa la tecla de Windows + R, escribe en el cuadro de texto SYSDM. CPL y presiona INTRO. En las propiedades del sistema, ve a la pestaña Opciones avanzadas, y en la sección Inicio y recuperación, haz clic en el botón Configuración. Fíjate en la pestaña Sistema operativo predeterminado para ver cuantos sistemas operativos hay registrados.
También puedes verificar el orden de arranque de la BIOS. Aquí es difícil orientarte del todo, pues versiones de BIOS hay muchas. Habitualmente a la BIOS se accede cuando arrancas el ordenador, pulsando una tecla que suele ser ESC, SUPR, F2, F5 o F8 (aparecerá un texto en pantalla al arrancar el PC que te dice que tecla sirve para abrir la BIOS). Doy por hecho que los discos son tipo SATA, donde no hay configurado físicamente que uno es el "maestro" y el otro el "secundario". Busca en la BIOS una sección que se debería llamar BOOT SEQUENCE para verificar que el orden de arranque sea el correcto.
Salu2.