Expediente de resolución por incapacidad permanente

Tengo un amigo que trabaja en la cadena de producción de IVECO, lleva 18 meses de baja. Ha recibido una carta de la Seguridad Social, para la incapacidad permanente, tiene 10 días para presentar formulario y documentación. Entiendo que quieren valorar el grado... También que mientras tanto seguirá cobrando lo mismo por IT. El problema es que la empresa le ha llamado comunicándole que tiene el finiquito a su disposición y mi pregunta es, ¿pueden finiquitarle mientras esté pendiente del grado de incapacidad permanente? ¿Entiendo qué si sigue cobrando, sigue de baja? Es que he leído que sólo pueden finiquitarle si el grado de incapacidad permanente es total o gran invalidez, ¿pero parcial?