Como parece que de momento nadie te dice nada voy a atreverme yo a hacerlo.
En primer lugar te diría que la extensión CSV de un archivo no garantiza que sea un verdadero CSV. Los CSVs son archivos de texto que pueden abrirse en Excel porque los diferentes campos de cada línea están separados por un carácter regional predeterminado (por ejemplo la coma para los angloparlantes y el punto y coma para español de España). El nombre de esa extensión viene de "Comma Separated Values" (valores separados por coma). De modo que tal como propones las cosas, yo diría que simplemente quieres fusionar línea a línea dos archivos de texto: situar en la primera línea de un nuevo archivo la primera línea de uno de ellos seguida de la primera línea del segundo y así sucesivamente.
Te sugiero que pruebes con esto:
@echo off
if exist pruebafinaljuntos.csv del pruebafinaljuntos.csv
set /a MaxLin=0
for /f "tokens=* delims=" %%a in (testlog1.csv) do (set /a MaxLin+=1)
set /a lin=0
for /f "tokens=* delims=" %%a in (testlog1.csv) do (
for /f "tokens=* delims=" %%x in (testlog2.csv) do (
echo %%a %%x >> pruebafinaljuntos.csv
goto :bucle
)
)
:bucle
set /a lin+=1
for /f "skip=%lin% tokens=* delims=" %%a in (testlog1.csv) do (
for /f "skip=%lin% tokens=* delims=" %%x in (testlog2.csv) do (
echo %%a %%x >> pruebafinaljuntos.csv
goto :sig
)
)
:sig
if %lin% GEQ %MaxLin% goto :fin
goto :bucle
:Fin
Aunque si de verdad quieres tratarlo como CSV con configuración regional "español de España" deberías poner un ";" en lugar del espacio entre %%a y %%x