¿Se puede hacer una liquidación parcial del impuesto de sucesiones?

Mi hermano y yo estamos metidos de lleno en el asunto de herencia de mis padres, ya hemos realizado el cuaderno particional y sabemos el reparto de los bienes de cada uno y la cantidad a liquidar por dicho impuesto. Existen discrepancias en cuanto a las valoraciones de algunas propiedades, ya que mis padres dejaron dicho en testamento que si uno de los dos hermanos saliera beneficiado, tendría que compensar al otro para que la herencia fuera a partes iguales.

El plazo para liquidar con la Junta de Andalucía finaliza en Abril de este año y no se puede pedir más aplazamientos, ¿puedo pagar mi parte del impuesto de sucesiones sobre ese cuaderno particional ya hecho y los formularios enviados a la Junta de Andalucía sin tener que esperar a llegar a acuerdos o a firmar ante notario para elevarlo a público? ¿Sigue siendo todo proindiviso, o tenemos que firmar los dos y pactar para terminar con este trámite?