Nacionalidad por simple presunción en españa

Somos cubanos y tenemos un hijo en españa nacido en junio de este mismo año 2018 presentamos su nacionalidad con toda la documentación que piden por simple presunción en los primeros días de septiembre y a los 15 días me avisan de que fue denegada no entiendo si la ley existe y todo está correcto porque me dicen en el registro civil que ya eso no existe que puedo mandar el expediente para madrid o reclamar no se que hacer me pueden ayudar