Cómputo de plazos recurso de alzada presentado telemáticamente

He presentado un recurso de alzada en un registro electrónico de un organismo público. Para contar el plazo de tres meses que tiene para su resolución,¿se cuenta desde el día siguiente al que figura en el registro de entrada, o si dicho escrito tienen que enviarlo a un superior para su resolución, se cuenta desde que éste recibe el recurso?