Viajar fuera de España (zona Schengen) con NIE caducado

Mi nombre es Sofía soy estudiante de doctorado en la Universidad Autónoma de Barcelona, tengo NIE estudiante. Mi NIE caducó el 30 de septiembre del presente año y ya me ha llegado la resolución favorable de la renovación.
Este viernes 16 de septiembre viajo a Portugal por motivos académicos (presentación en congreso) y regreso el lunes 18 de noviembre. No he podido encontrar cita para sacar la nueva tarjeta, pero la resolución de renovación es favorable. Tampoco he podido encontrar cita para solicitar carta de retorno. Portugal es espacio Schengen ¿tendré problemas para entrar a España el día lunes?