Internet no conserva configuración avanzada

Accediendo a una red con dominio como administrador cambio una serie de parámetros en Internet Explorer 11 y 8, pero en algunas ocasiones, solo en algunas, cuando el usuario entra con su usuario0 y contraseña no le mantiene los cambios que yo le he hecho, pero en cambio en otros si. ¿A qué se puede deber? ¿Cómo lo soluciono?