Cobro de incapacidad temporal por parte de la mutua

Me despidieron de mi empresa, al darme de baja en el periodo de prueba.

Llevo dos meses cobrando a través de la mutua, por la incapacidad laboral y, que seguro, me llevará algún tiempo más.

Anteriormente a entrar en dicha empresa, estaba cobrando subsidio de mayores de 52 años.

Cuando reciba el alta tendré que volver a solicitar el subsidio,

Mi pregunta es, tendra consecuencias el cobro de la incapacidad actual, ¿con mi solicitud de subsidio?