Instalar junta inferior puerta abatible mampara

Tengo una mampara con un cristal fijo de 10mm junto con una puerta abatible a 90° de 6 mm, quedando sellada mediante juntas magnéticas.

Coloque una junta inferior a la puerta y no consigo evitar que pierda agua en el punto de unión de las magnéticas y la junta inferior. ¿Hay algún truco de cómo debo cortar la junta inferior para que sellé lo mejor posible?