Puede pasar lo siguiente:
Al utilizar anticongelante la densidad del fluido (agua-anticongelante) aumenta ya que el anticongelante es más denso que el agua, si el fluido es más denso la bomba puede quedarse "pequeña" para mover el fluido en caudal suficiente para que se active el detector de caudal ( no se si tu caldera lo lleva, cada vez lo llevan mas modelos).
Lo que puede ser que te esté pasando es que al no detectar el nivel mínimo de caudal circulando el detector de caudal (o interruptor de flujo) no cierre el contacto que permite que la caldera arranque (esto sirve para evitar que el quemador se ponga en marcha si, por ejemplo, la bomba se rompe y no funciona, impidiendo que el agua de la caldera se sobre caliente, se evapore y se averíe la caldera).
Supongo que utilizas el anticongelante porque tienes un recorrido muy largo por el exterior y que la caldera esta parada durante mucho tiempo ya que si no no tiene sentido utilizar anticongelante en un circuito de calefacción ya que casi todas las calderas llevan incorporada una función anti-hielo.
Otra pega que tiene utilizar anticongelante es que disminuye el calor específico del fluido en relación con el agua, lo que provocará que además de circular menos agua por el circuito esta trasporte menos calor, lo que incidirá sobre el calor cedido a los radiadores.