Verifica el sensor de caudal.
Si el flujo de agua no es el esperado, entonces es posible que el sensor oscile y te corte la alimentación para evitar males mayores. Verifica el circuito hidráulico.
Como a buen seguro lo habrás instalado "mal", en línea con el equipo de filtración* lo que puedes probar a poner a circular el agua poniendo la válvula selectora en modo RECIRCULACIÓN ya que así el caudal al no pasar por el filtro aumenta y podrás hacer la prueba.
En caso de ser así, puedes reclamar al fabricante del intercambiador de calor que te ofrezca un sensor de caudal de menor flujo, que te pemita calentar con el caudal mínimo (por lo general no sabrán de qué les hablas..)
*nota: No es buena práctica aprovechar el sistema de filtración para calentar el agua. las necesidades de la bomba para la función para la cual fué diseñada difieren de las necesidades de climatización. Lo correcto es instalar el calentado con SU bomba específica y que se ponga en marcha cuando sea menester.
Si el flujo fuera el correcto, es decir que cumple el mínimo indicado en la ficha técnica del producto, cabe esperar que el error esté en el termostato de alta. Aparte del termostato de baja, que es el que empleas para seleccionar la temperatura deseada, tienes uno de seguridad que corta al llegar a los 45ºC-50ºC. A veces éste sale mal tarado y te corta a menos temperatura...
Referente al "ruido", seguramente es normal y es debido al contactor que tiene dentro que suele generar un zumbido cuando está en marcha.
Saludos,
JM
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