No, no son lo mismo. Tienes dos buenas definiciones en wikipedia.
http://es.wikipedia.org/wiki/Protoplastohttp://es.wikipedia.org/wiki/ProtoplasmaEl protoplasma es el contenido de una célula que podríamos llamar "útil" o "vivo", y está formado por el citoplasma y el núcleo con todas sus moléculas, aminoácidos... La célula estaría constituida por el protoplasma más la membrana celular. Se podría decir que el protoplasma fue el estado inicial de la vida antes de que las células se encapsularan con la membrana.
Por otro lado, el protoplasto es una célula, normalmente de planta, bacteria u hongo, a la que se le ha eliminado total o parcialmente la pared celular mediante técnicas de laboratorio.