Me alegra que tengas un proyecto relacionado con la biología.
Bueno, en primer lugar, debes conseguir una buena fuente de información. Como bibliografía te recomiendo la Wikipedia; allí, por ejemplo, tú buscas un organismo determinado y te dan todos los datos taxónomicos del mismo (con eso resuelves el problema de la clasificación). En la wikipedia lo mismo pones "perro" que "Canis familiaris", te lo encuentra; además de proporcionarte información ampliada sobre el organismo. Pero bueno, te adelanto: según la clasificación más aceptada, sólo hay 5 reinos: Móneras, Protista, Hongos, Plantas y Animales (la clasificación según este nivel taxonómico es fácil). Acerca del Dominio: el dominio es la clasificación taxonómica más alta, y está inmediatamente por encima de Reino. Sólo hay 3 Dominios: Bacteria (ahí están las eubacterias o bacterias verdaderas, se excluyen las arquebacterias), Archae (sólo para las arquebacterias) y Eukarya (los demás organismos eucariotas: protistas, hongos, plantas y animales). En cuanto a especificar si es eucariota o procariota, el mismo dominio te lo dice. Si pertenece a Eukarya, es eucariota; sino es procariota, aunque recientemente se esta debatiendo si ubicar a las arquebacterias en el patrón celular procariota, hasta ahora están ahí, pero eso se discute.
El nivel de organización: si se trata de un organismo, el nivel de organización es ORGANISMO, ni célula, ni población. Se hace una excepción si se trata de un organismo unicelular, en este caso: coincide el NIVEL CELULAR con el de ORGANISMO.
El hábitat te lo dirá la wikipedia o la fuente de información que busques. Los usos también. Recuerda que los microorganismos tienen una amplia importancia para el hombre, los animales y el medio ambiente.
Te recomiendo que pongas en tu tabla representaciones de organismos de los 5 reinos, para que tu trabajo sea abarcador. Incluso podrías incluir organismos que estén relacionados (los de un mismo ecosistema) o distintos ecosistemas, como gustes. Sólo trata de llevar variedad, para enriquecer tu trabajo.
A continuación te dar una dirección de una página que seguro te va a servir
http://www.cienciaybiologia.com/