¿Alternador deficiente puede dañar la computadora?

El vehículo ( meriva 1.8 ensamblada en brasil año 2008) sufrió un siniestro, entro en el taller, para hacerle la latoneria se desconecto la batería (que estaba fallando, según luz indicadora en el tablero) luego de varias semanas se intento prender el vehículo hasta con batería nueva y este más nunca encendió... Por garantía del taller de latoneria y pintura se llevo el carro a un concesionario para que lo chequearan, y allí nos informaron que era la computadora que se había quemado!
Lo peor era que el asegurado o dueño del carro no tenia el car pass, (código de seguridad del vehículo) lo que trajo como consecuencia tener que cambiar: computadora, inmovilizador, radio reproductor (el original estaba bloqueado a su recepción) cloch ( no se como se escribe), modulo de este, llave nueva con transponder nuevo ( porque el sr. Tampoco tenia la segunda llave necesaria para la programación del vehículo... Y después de todo esto se consiguió encender el vehículo... Pero ahora este da código de que el alternador no esta mandando corriente a la batería y la batería que esta nueva la descarga rápidamente...
Yo me pregunto, ¿es posible que no fue culpa del taller de latoneria, si no que el carro
entro ya con la falla del alternador y este afecto los componentes eléctricos ya mencionados y la luz de la batería que indicaba en el tablero a la recepción del vehículo era el indicativo de esto? O ahora esta falla del alternador es producto, ¿consecuencia de todo lo que le hemos camnbiado al vehículo?
La verdad, quisiera saber hasta donde llega mi responsabilidad como taller... ¿debo asumir también la reparación o cambio del alternador?