Una pregunta bastante interesante, pero no tan sencilla de contestar, ya que faltan datos.
Piensa.
En el mundo existen tan variadas como incontables empresas e instituciones, que llevan su información y respaldos de las mismas, de formas tan diferentes como te las puedas imaginar.
Las grandes empresas por lo general externalizan sus servicios (OUTSOURCING) para mayor seguridad, llevando su información mediante redes o dispositivos a enormes servidores alojados en algún lugar específico.
Puedes encontrar formas de respaldo mediante CINTAS, Discos Duros Externos, Servidores conectados a la red corporativa y hasta respaldos en DVD'S o BLUE RAY
Los programas para realizar esta tarea son tan variados como te los puedas imaginar. Esta genie soft, acronis backup, nti backup, handybackup, cobian backup, nero backup, cucku backup, norton backup, turbo backup.
Los enlaces a estos excelentes software son los siguientes:
http://www.genie-soft.com/
http://www.acronis.com/enterprise/
http://www.ntius.com/en/us/home/default.asphttp://www.handybackup.com/
http://www.educ.umu.se/~cobian/cobianbackup.htmhttp://www.nero.com/esl/products.htmlhttp://www.cucku.com/
http://www.symantec.com/norton/ghosthttp://www.filestream.com/turbobackup/
Te reitero que las grandes empresas contratan a especialistas externos para realizar estos respaldos corporativos a gran escala mediante ftp hacia servidores dedicados. Y depende además de la forma que tienes distribuida y administrada la red, los tipos de servidores y plataformas, los permisos especiales, etc.
Espero haberte dado algo de información para que puedas buscar e indagar más al respecto.