Olor a agua estancada en red domiciliaria

Descripción general: Casa con una perforación de la cual de extrae agua de las napas subterráneas por medio de una bomba y es elevada a un deposito para uso sanitario para luego ser distribuida por una red de caños de polipropileno (negro) expuestos sobre el techo y por caño plástico (rojo) embutido en las paredes hasta la grifería.
Problema: Por falla en la bomba extractora, como medida de emergencia, se bombeó agua de la piscina al deposito durante dos días. El agua estaba cristalina con un poco de suciedad de tierra porque se estaba en proceso de llenado de la piscina.
Solucionado el inconveniente de la bomba se vuelve al sistema original, pero resulta que ahora el agua sale de los grifos con un olor a "agua estancada".
1° Intento de solución: Añado 1 litro de cloro al deposito con 400 litros de agua, lleno todas las cañerías con esa solución y dejo actuar durante toda la noche (10 hs. Aprox.) . Se desecha el agua clorada y se renueva con agua nueva de la perforación.
Resultado: Un dia con agua con olor a cloro y luego nuevamente olor a "agua estancada"
2° Intento : mismo procedimiento que el anterior pero con 2 litros de lavandina. Mismo resultado.
3° Intento: mismo procedimiento pero 10 litros de cloro en 200 lts de agua. Mismo resultado.
Pregunta: Cual es el problema y como se soluciona