En contestación a tu pregunta, no se muy bien si te puedo ayudar ya que no se muy bien cual es tu problema. En principio las dos versiones de Facturaplus y Contaplus deben de ser compatibles, es decir hay versiones que no funcionan muy bien unas con otras. Si ese no es tu problema, en Facturaplus existe un botón en el que se te pide el enlace con Contaplus, ese botón tienes que configurarlo anteriormente entrando en utils, en ella te pides que le des la ruta de la empresa que tengas creada en Contaplus (botón examinar) una vez encontrada la ruta ya tienes configurado el facturaplus y puedes pasar toda la facturación tanto de clientes como de proveedores.