Atrasos IRPF

Tal y como lo veo, el asiento que planteas no puede ser porque te quedaría la cuenta 4751 descuadrada de por vida (salvo que vayas a proceder al recobro al trabajador, ya que a fin de cuentas lo que ha pasado es que le has pagado de más), por otra parte la cuenta 669 son otros gastos financieros, por lo que tampoco la utilizaría, antes crearía una cuenta en el subgrupo 63 sobre multas y sanciones o algo así En definitiva los asientos que yo haría serían:
Caso 1. No procedemos al recobro al trabajador.
(679) Gastos y perdidas de ejercicios anteriores
(6312) Intereses de mora
A
(4753) HP acreedor por impuestos pendientes (o algo así)
Cuando pagas la sanción:
(4753) HP acreedor por impuestos pendientes
A
(57) Tesorería
Debes de tener cuidado a la hora de preparar el impuesto sobre sociedades porque las multas y sanciones, en principio, no son gastos deducibles y deberás de proceder al ajuste pertinente en la declaración
Caso 2, procedes al recobro al trabajador
460 Anticipo de remuneraciones
6312 Multas y sanciones
A
(4753) HP acreedor por impuestos pendientes
Cuando pagues la sanción y devuelvas lo no retenido
(4753) HP acreedor por impuestos pendientes
A
(57) Tesorería
Cuando recobres al trabajador
(57) Tesorería
A
Anticipo remuneración(460)
No sé si te habré ayudado, si no pregunta otra vez y miramos a ver.
Un saludo
Manuel
P.D. A modo de reflexión, ¿no te parece que los intereses de mora los debería de pagar hacienda que a fin de cuentas fue quién tardó en darse cuenta del error?

Creo que te he respondido pero tengo problemas de conexión si eso me preguntas otra vez

Hola, primero muchas gracias pero quiero aclararte algo por si cambia la respuesta:el trabajador ya no esta en la empresa, y lo que pagamos no es una multa (la multa vendrá ahora por correo) sino que pagamos la diferencia entre el % de irpf calculado por nuestra asesoría que nos hace las nominas y el % que dice Hacienda que era el correcto y ahora ¿cómo contabilizo la multa? Gracias

Ese asiento es incorrecto. Supongo que en la 640 contabilizarías el bruto del trabajador en su día, por tanto, el gasto ya lo tienes contabilizado. El apunte seria así:
640. Bruto sueldo(debe)
475. Ret. Irpf trabajador
642. Ret. Ss. Trabajador
57. Lo que le pagaste liquido.
Cuando hagas la declaración cancelaras el importe retenido contra la cta del banco que pagues la liquidación.

Creo que no pues han pasado dos años ahora solamente pago la diferencia entre lo retenido y lo que era correcto retener y se lo pago a hacienda pero el trabajador ya no está en la empresa