A ver amigo, el problema es que has asumido hacer la factura por la totalidad de la maquinaria, cuando en realidad no puedes hacerla... a partir de ahí cualquier cosa que quieras hacer o que hagas comprenderás que muy buen encaje no tiene.
Como no me dices las cifras, me voy a inventar yo unas. Imaginemos que la máquina vale 1.000 € y el cliente te paga 600 €, y ha quedado en pagaros en cuanto entregues la maquina los 400 restantes más el iva, que son 210. Lo legal:
El anticipo por 600
600 € (437) a (700) 495.87 €
(477) 104.13 €
y el cobro del anticipo será:
600 (572) a (437) 600
Si lo cobras por el banco.
La venta luego la harás por el total de la maquinaria, y en la factura incluirás una linea en negativo con el importe que te pagó anticipadamente, para que al contabilizar lo hagas por el neto que queda por facturar.
En este esquema de asientos no cabe facturar la máquina completa, y cobrar una parte sólo. Así vosotros asumís un iva que no corresponde, un I.Sociedades que no os corresponde y facturáis una máquina que no tenéis, contraviniendo el reglamento de facturación que te enlacé. En román paladino: vuestro cliente os pide una triquiñuela legal, que muchos hacen, para poder beneficiarse ellos. Eso, a mi modesto entender, a vosotros os perjudica claramente. ¿Qué pasa si tenéis una revisión de la agencia tributaria? Pues que os llamarán pardillos por adelantar impuestos indebidamente., y que os pueden sancionar por colaborar en una operación no ajustada a las normas.
Ahora bien, esto lo hacen muchas empresas como la vuestra, que se dedican a la compra-venta de maquinaria y que se tienen que ajustar a estas triquiñuelas para poder vender (cualquier argumentación es poca hoy en día para vender una máquina). Imagino que la operación además será importante, de bastante dinero. Y cualquiera se arriesga a perder una operación por quítame allá una factura... pero claro, eso para vosotros tendrá implicaciones fiscales y, por qué no, incluso legales.
Lo que quiero que entiendas es que el plan contable y las normas contables no contemplan el contabilizar cosas bien cuando no se hacen bien, para que entiendas el paralelismo, es como si me preguntaras "¿como se contabiliza una venta en negro?" Yo te diría: "pues sobre un papel en blanco" pero eso no va a legalizar la venta, ¿verdad? Pues lo mismo.
Amigo, espero que me puntúes bien la respuesta, te estoy bastante tiempo...