Reparación de tejado en finca de suelo protegido o rustico

Buenos Días,

Vivimos en una finca de suelo protegido o rústico, es una construcción antigua de mas de 100 años, el tejado de la nave se ha derrumbado y hemos llamado a los albañiles para repararlo, solamente el tejado, las paredes siguen siendo las de adobe.

El ayuntamiento nos ha solicitado que pidamos una licencia. Anteriormente ya solicitamos licencias para otras obras y nunca se nos han concedido por ser terreno protegido.

En este caso, probablemente tampoco nos la den pero tampoco han parado la obra y el tejado ya esta terminado.

Que debemos hacer si no nos dan el permiso? Tendremos que pagar la sanción de todas formas tengamos licencia o no la tengamos? Hay riesgo de que lo hundan? Es primera vivienda.

Gracias