Trabajador activo discapacitado

Antes de nada quiero enviarle un saludo. Estuve en situación de incapacidad temporal desde el día 15 de julio de 2009 hasta el día 13 de enero de 2011, fecha en la que INSS me reconoció una incapacidad permanente absoluta. El 15 de diciembre de 1999 me reconocieron una discapacidad del 75% con ayuda de tercera persona. La empresa me ha estado abonando la nómina completa desde el mismo día de la baja hasta el día 12 de enero de este año. En enero de 2010 presenté a la empresa el modelo 145 para que retuvisen el porcentaje de IRPF correspondiente.
Al hacer la declaración del IRPF del año 2009, ante mi desconocimiento del tema, me apliqué la reducción como trabajador activo discapacitado. Hacienda me hizo una paralela, ya que para ésta no era trabajador activo discapacitado, por no haber trabajado (más bien acudido al trabajo) en el período que va desde el 15 al 31 de diciembre al menos un día. Al final la cantidad que me devolvieron no tuvo nada que ver con la que yo había calculado.
Pues bien, he permanecido durante todo el año 2010 en situación de incapacidad temporal. Al ver el borrador de la renta de 2010 vuelvo a aparecer como trabajador activo discapacitado. La empresa apenas me ha retenido nada, por lo que según el borrador me sale a devolver todo lo retenido. Tengo pensado pedir hora en la delegación de hacienda y que me lo modifiquen, ya que no quiero que me envíen una paralela con su sanción correspondiente. He hecho cálculos y la diferencia entre el borrador y lo que me sale a mí (de acuerdo con las normas internas de hacienda) es bastante cantidad, ¿ya qué tendría que pagar cerca de 800?. La empresa me retuvo de acuerdo a lo declarado por mí en el modelo 145 y yo declaré todas mis circunstancias personales.
Mi pregunta es la siguiente: ¿Quién debe abonar la diferencia entre lo que me ha retenido la empresa y lo que me debían de haber retenido según hacienda, la empresa o yo?
Saludos.

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