Deducción de la cuota de un autónomo colaborador

Buenas tardes.

soy un autónomo colaborador en la empresa de mi marido, recibo una nomina por el trabajo que realizo.

mi pregunta es la siguiente. Como deduciría la empresa el gasto de la cuota de autónomo? Tendría que reflejarlo en la nomina como especie? Y si lo declara como especie, podría deducir yo el pago de la cuota en mi declaración de IRPF para compensar la retribución en especie?