Los autonomos pueden percibir dietas en su nomina?

Una empresa dedicada a la publicidad, un autónomo administrador que recibe su nomina mensual. Realiza desplazamientos porque su función es contratar publicidad a los clientes, puede recibir dietas? Y estas dietas estarán exentas igual que las dietas percibidas por los empleados? 
En el caso de que no estén exentas , creo que he metido la pata un poco. Pues en varias nominas se le han pagado dietas y no se ha retenido por ellas. Como se puede solucionar? 
Muchas graciass!!