Documentar Pago Compra vivienda

Buenas, pretendo vender una vivienda. El precio son 200.000€ de los cuales, a la firma del contrato de compra-venta me abonaría el comprador 50.000€ en metálico, un segundo pago de otros 50.000€ el día anterior a la firma, y el resto los 100.000 entiendo que por talón del Banco con el que se Hipoteca.
Tengo entendido que hay que documentar los pagos realizados para la compra-venta y quería saber si para mi trae alguna complicación los cobros en efectivo y como se documentan ante notario... 
Hay algún tipo de perjuicio para vendedor o comprador pagando así.?
Gracias.