¿Puedo coger la baja tras haber estado 2 años con una incapacidad permanente total?

Hola;

Acabo de pasar la revisión por agravación o mejoría de la incapacidad permanente total que tengo concebida, el caso es que me han contestado diciendo que me van a dar de alta y voy a tener que incorporarme a mi puesto de trabajo ya que tengo reserva de puesto. El problema es que como estoy actualmente no puedo desempeñar mi trabajo, estoy operado de las cervicales y tengo ciertas limitaciones, según los informes médicos que dispongo, no puedo realizar movimientos repetitivos, ni esfuerzos físicos ni nada que pueda sobrecargar el raquis cervical, a parte de que tengo parestesia en los brazos, dolores constantes y trabajo en una fabrica, pero todo esto al evi no le importa.

Mi pregunta es: Una vez me reincorpore al trabajo puedo coger la baja por otro motivo distinto al de la ipt? Si puedo coger la baja, quien me la da, el INSS o el medico de cabecera? Esta baja estaría retribuida?