Tengo hipotiroidismo porque se me atrasa tanto la regla?

hola muy buenas, mira soy una chica de 22 años, tengo hipotiroidismo tomo eutirox 50 mg hace casi 2 años pero desde el año 2011 para este año, se me atrasa muchísimo el periodo,12 o 15 o un mes sin regla y me hecho varios test de embarazos me dan negativos, entonces cuando e tenido consulta con mi especialista, endocrino me dice que eso no tiene nada que ver con el hipotiroidismo pero algo sera no? Es que estoy muy preocupada la verdad, y me gustaría saber también si puedo tomar o ponerme un anticonceptivo es que no se si se podrá poner tomando estas pastillas de eutirox?.. Bueno voy a preguntar otra cosita a la hora que quiera plantearme de tener un bebe, tendré problemas al embarazo? O tendrá problemas el feto? Lo heredara mi hij@? Es que estoy asustada con esto del hipotiroidismo. Bueno pues lo agradecería mucho si usted me respondiera a mi duda. Un saludo