Temperatura desconocida

Tengo un ordenador con un solo ventilador en la CPU (aparte claro del de la fuente de alimentación). Y mediante un programa (SPEED FAN 4.7), me salían advertencias de que el disco duro se calentaba en exceso, lo cual era cierto pues no se podía ni tocar y se notaba que el ventilador de la CPU subía mucho de revoluciones cuando hacia mucho uso del disco duro. Le compre un ventilador para el disco duro y el problema se soluciono (por cierto fácil de instalar y barato) y desde que instale el ventilador siempre tiene una temperatura más o menos estable, y ademas se puede tocar si quemarme (ahora suele estar entre los 30/35 grados, cuando antes subía por encima de los 60 grados. Pero dentro del mismo programa me lee tres temperatura una la del disco duro, otra la de la CPU (que suele denominar como TEMP 1, e incluso me da la velocidad del ventilador) y una tercera (que denomina TEMP 2, y que no da velocidad de ventilador, ya que no tengo). Esta ultima temperatura suele mantenerse dentro de unos limites normales, excepto cuando utilizo algunos juegos en los que se dispara (cerca de los 60 grados) y el programa me advierte de sobrecalentamiento. Y mi pregunta es ¿esta temperatura de que es?, yo creo que sera de la placa madre o de alguno de sus componentes. Y la segunda y evidente pregunta es ¿cómo lo soluciono?, imagino que colocando otro ventilador pero ¿dónde?, aunque si me respondes a la primera imagino que la segunda ya se resuelve sola. Por cierto, paa mejorar la refrigeración primero le hice unos agujeros en la parte superior de la caja, pero en vista de que esto no aporto mucho recurrí a quitarle las dos tapas laterales de la caja, lo cual si que ha solucionado el problema en algunas ocasiones, pero no en todas, sobre todo en verano.