Por partes:
Si lo que vas a realizar es un "ralenti" al revés(o cámara accelerada), esta claro que si que va a importar que el audio se encoga para conseguir que ese se sincronize perfectamente con el video. En cual caso tendrás que aplicarle el efecto correspondiente que no es más que un "time streching", que consiste en remuestrear la pista de audio para encogerla, con la posibilidad o no de subir el tono(pitch) al mismo tiempo(efecto pitufos)
Ahora si lo que vas a hacer es retocar el video para reducir el espacio ocupado, reduciendo su numero de fps, sin cambiar su longitud, eso significa que solo vas a remuestrear el video, porque no cambiara su duración (tiempo total)como en el primer caso donde se reduzco el tiempo al mismo tiempo que el tamaño, pero si su tamaño(espacio en disco)
En ese caso, el mismo programa se encarga de reposicionar las claves del sonido en función de la nueva configuración de video, te aconsejo de usar las intentar de claves por defecto que te propone el programa para evitar sorpresas desagradables!
Espero que te es un poco más claro!
Pues: las claves, sirven al reproductor para saber como sincronizar el audio y el video: cada tantos cuadros(dependiendo del codec utilizado), hay una clave que sirve de posicionamiento del audio. Al reducir los fps, lo que haces es decir al reproductor que los cuadros claves están más acrecados los unos de los otros en 25fps que en 29fps. ¿Ok? ;)
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