Puedes tener como máximo 5 tramos de cableado y 4 switches o routers para que no tengas problemas de latencia considerables.
Según las especificaciones ANSI debes tener un centro MDF o un Site en cada piso. Si no te es posible tener en cada piso, seria muy conveniente tenerlo en cada edificio de perdido. Independientemente de firewalls y proxis que quieras tener, primero debes hacer un diseño a detalle de la topología que vas a usar, porque esta es la base para que toda tu red tenga buena conectividad. Tu centro de cableado debe convenientemente ir al centro de cada piso para que los tendidos de cable no superen los 90 metro 2.
1.- Primero que nada, determina una topología eficaz, tomando en cuenta como primer enemigo a vencer la latencia de las tramas de bytes. Perdidas de señal. Contaminación EMR, infraestructura eléctrica adecuada, da una leída a los estándares ANSI, EIA, TÍA, e ISO referentes a la red. Tienen muchas especificaciones que te serán de gran ayuda.
Recuerda que el diseño de tu red empieza en la capa física del modelo OSI.
2.- Si pisas usar fibra óptica para conectar los edificios, no va a servir de nada si los demás aparatos que usas, el cableado y la infraestructura no le dan el kilo a la fibra óptica.
3.- En caso de usar tecnología inalámbrica para unir los edificios. Ten en cuenta lo referente a los estándares de tus aparatos IEEE 802.11, una búsqueda por wikipedia te da un panorama mas claro, así también como informarte que canal del ancho banda (Ghz) tiene menos trafico, ruido o contaminación en el área.
4.- Después de determinar que tecnología te es mas conveniente, intenta simplificar la gestión de datos. Toma los, firewalls, proxis, routers, nics, dominios, etc, como checkpoints que retardan algunos milisegundos precioso cada uno, el flujo de datos en tu red.
Entre mas inadecuado sea el cableado, la infraestructura y la gestión de datos, una fibra óptica no te serviría de nada. Te recomiendo una conexión inalámbrica y que los switches que utilices queden preparados para futuro crecimiento con 10/100/1000 mbps. La red la podrías hacer como sea, pero su eficacia y velocidad son determinados por muchos puntos a tomar en cuenta.