Desinstalar LInux

Hola Experto, gracias de antemano por tu atención. Mi problema es el siguiente. Instalé en un disco duro vacío formateado en fat 32 el sistema operativo Suse que trae por defecto el Yast como instalador y se instaló muy bien. Yo apenas estoy aprendiendo linux y como práctica quizé desinstalar linux, así que metí un disco de arranque de win 98 y eliminé las particiones no de dos que creo linux, el problema es que cuando le di format c:, me dijo que el formato no era compatible. ¿Qué debo hacer si quiero instalar nuevamente Linux?, Nota, Lilo, el gestor de arranque se instaló en el sector de arranque del disco duro. De antemano gracias.